本會「新豐教會」隸屬台灣基督長老教會「台南中會」,1955年長老教會「倍加運動」由母會歸仁教會申請設立為其開拓支會,5月30日正式開幕,信徒約有10名左右。1965年2月中會第35屆春季議會中昇格堂會。
關廟地區的福音工作早在主後1898年信徒阮振德先生在下湖村一面賣藥,一面傳福音就開始,當時約有信徒10餘人。4年後阮振德先生獲得醫生執照而遷移他地開業,終而分散。1906年醫師蔡得一先生得到林燕臣牧師鼓勵,在關帝廟的過坑仔開設「福音堂」。1907年佈道所遷移到關廟街。1912年佈道所歸屬歸仁教會改為「關帝廟支會」,1917年 7月26日再改名稱為「歸仁北支會」。
1950年台灣光復後5年,台南聖潔派教會計劃來關帝廟開設教會,信徒汪文取先生鼓勵其他信徒在張盧浮雲女士自宅開始禮拜,由陳木先生兼任傳道事工。1951年遷移汪文取先生自宅聚會禮拜。1954年遷移至蔡靖長老自宅聚會,直到舊禮拜建堂完工(1957年)
1956年7月購買關帝廟地番769號土地為現址教會用地。1962年8月購禮拜堂後面土地440坪。1963年2月購教會前側面土地、房屋購置。1983年11月購禮拜堂南側土地123坪。2003年購買歸仁沙崙1001-1102地號約455坪農地一筆。2007年新購恩典門左側,文衡段970地號,透天厝一間約22坪。
除土地多次購置擴充外,建築物更歷經多次的興建與整修,1957年3月25日舉行舊建堂開工禮拜(已拆除)。1969年9月開辦新豐托兒所。1984年5月27日重建禮拜堂竣工,開始於新禮拜堂作禮拜。1992年3月恩典樓完工。
2007年5月教會文衡路恩典大門、地板與新辦公室整修竣工。2009年起新豐幼兒園停止招生,2010年興建信心樓,2011年11月禮拜堂翻修,2012年恩典樓騎樓咖啡雅座落成,2015年10月恩典樓一樓佳美館與地下室磐石館圖書室暨兒童大喜樂日場地整修工程完工。2015年購置恩典樓後側,文衡段985地號約4.9坪共有持分土地。2018年信心樓喜樂館咖啡館與恩典樓幼兒活動場地整修完成。2019年5月購置文衡段地號988、1174兩筆土地共140坪土地,2019年10月購置文衡段986地號(正義街81號)約25坪暨地上物一樓房舍。2019年12月完成正義街平安門出口,平安廣場落成感恩禮拜。
本會2014年成立佳美關懷協會承辦市政府山西里社區關懷據點,服務關廟社區長輩。並承辦市政府小衛星計畫課輔班課程。每周二社區手工藝日間托老課程,平均十名出席。每周三上午辦理佳美社區日語課程,七十名報名參與。每周五與關廟地區國小、國中合辦教育部樂齡核心課程,每周平均五十名出席。其於不同時段上午與關廟衛生所等單位合辦社區醫療講座。
2017年臺南市第三新住民中心進駐本會,與本會長期合辦新住民各項「雙福:福音與福利」計畫。近二十年來教會以「生命教育理念」作為宣教策略,提供關廟社區總體營造的中心據點,並以各項生命教育為理念的活動/計畫提升關廟地區居民身心靈建全,共建「更新又豐盛」的上帝國。