มูลนิธินี้ชื่อว่า มูลนิธิสมเด็จพระญาณสังวร สมเด็จพระสังฆราช วัดบวรนิเวศวิหาร ในพระบรมราชูปถัมภ์ ย่อว่า ญสส
เรียกเป็นภาษาอังกฤษว่า Somdet Phra Nyanasamvara Somdet Phra Sangharaj Wat Bovoranives Vihara Foundation under Royal Patronage
จุดมุ่งหมายของมูลนิธิ
๔.๑ เพื่อบำเพ็ญสาธารณะประโยชน์ สาธารณะกุศล และอาทิการศึกษาสงเคราะห์
๔.๒ เพื่อส่งเสริมกิจกรรมทางพระพุทธศาสนา วัฒนธรรมและประเพณีอันดีงามของชาติไทย
๔.๓ เพื่อการบำเพ็ญประโยชน์ในวันประสูติหรือวันสิ้นพระชนม์ สมเด็จพระญาณสังวร สมเด็จพระสังฆราช สกลมหาสังฆปริณายก วันที่ ๓ หรือ ๒๔ ตุลาคม ของทุกๆ ปี โดยให้มีการจัดมอบทุนการศึกษา นักเรียนระดับประถมศึกษา ระดับมัธยมศึกษา ระดับอุดมศึกษาแก่นักเรียนและโรงเรียนที่เกี่ยวเนื่องกับสมเด็จพระสังฆราช และอื่นๆ ตามที่คณะกรรมการเห็นสมควร และมอบทุนรักษาพยาบาลแก่ผู้ป่วยยากไร้ ที่อยู่ในโรงพยาบาลที่ทรงสร้างอาคารถวายในพระนาม สมเด็จพระสังฆราช และในพระนามสมเด็จพระญาณสังวร สมเด็จพระสังฆราช สกลมหาสังฆปริณายก โดยผ่านการกลั่นกรองคัดเลือกจากคณะผู้บริหารของโรงเรียน และโรงพยาบาลนั้นๆ หรือจากหน่วยงานราชการ
๔.๔ เพื่อปกป้องรักษาและเชิดชูพระเกียติคุณอันสูงส่งงดงามของสมเด็จพระญาณสังวร สมเด็จพระสังฆราช สกลมหาสังฆปริณายก ให้คงอยู่อย่างมั่นคงสง่างามเป็นที่สักการะชื่นชมของปวงพุทธศาสนิกชนสืบไป
๔.๕ ไม่ดำเนินการเกี่ยวข้องกับการเมืองแต่ประการใด
เครื่องหมายของมูลนิธิฯ คือ อักษรพระนามย่อ ญสส ภายใต้เศวตฉัตร ๓ ชั้น ระบายขลิบทอง ชั้นล่าง
เครื่องหมายของมูลนิธิฯ คือ อักษรพระนามย่อ ญสส ภายใต้เศวตฉัตร ๓ ชั้น ระบายขลิบทอง ชั้นล่างสุดห้อยอุบะจำปาทอง หมายถึง สมเด็จพระญาณสังวร สมเด็จพระสังฆราช สกลมหาสังฆปริณายก ผู้ทรงพระคุณธรรมอันประเสริฐ สมบูรณ์ด้วยศีลสมาจารวัตร มีกลีบบัวหลังเบี้ยล้อมรอบเป็นวงรีรูปตั้ง มีข้อความโดยรอบว่า "มูลนิธิสมเด็จพระญาณสังวร สมเด็จพระสังฆราช วัดบวรนิเวศวิหาร" ซึ่งเป็นพระอารามหลวงที่ทรงสถิตอยู่ ถัดกลีบบัวและตัวอักษรข้อความมีเกสรนับได้ ๑๐๐ เมล็ด หมายว่า ทรงเจริญพระชันษาครบ ๑๐๐ ปี ที่ทรงยังหิตานุหิตประโยชน์อันไพศาลแก่พระบวรพุทธศาสนาตลอดมา ด้านล่างสุดมีข้อความว่า "ในพระบรมราชูปถัมภ์"
สำนักงานของมูลนิธิตั้งอยู่ที่ อาคารมนุษยนาควิทยาทาน
วัดบวรนิเวศวิหาร ๒๔๘ ถนนพระสุเมรุ
แขวงบวรนิเวศ เขตพระนคร กรุงเทพมหานคร ๑๐๒๐๐