La localidad se encuentra a una mediana altura de 80 metros sobre el nivel del mar. En el lรญmite norte del municipio se localiza en las coordenadas geogrรกficas, 17ยฐ 23โ latitud norte y 95ยฐ25โlongitud oeste. Sus colindancias son:
Al Norte colinda con Jaltepec de Candayoc, comunidad perteneciente al municipio de San Juan Cotzocรณn, (ambas comunidades son separadas por el rio โJaltepecโ). Al Sur con S
an Pedro Acatlรกn, al Suroeste con los Fresnos, al Este con Constituciรณn Mexicana y al Oeste colinda con arroyo tejรณn. San Jose de las Flores tiene la categoria de Agencia de Polรญcia Municipal, sus principales autoridades son el Comisariado Ejidal y el Agente Municipal; ellos convocan dos tipos de asambleas, la Ordonaria y la Reglamentaria. Sus princiapales producciones son la ganaderia y los citricos (limon y naranja). Es una comunidad con muchos aรฑos de antigรผedad, las personas que en ella habitan son de diferentes Estados de la Republica, la mayorรญa habla el espaรฑol, solo un 5% aproximadamente practica alguna lengua materna. La fiesta patronal se celebra el 18 y 19 de Marzo en honor al santo patrรณn "San Jose", en ella solo participan las personas que son creyentes en la religiรณn Catรณlica. Realizan calenda, bautizos, bodas, primera comuniรณn, confirmaciones, etc. Los jรณvenes se organizan junto con las autoridades municipales realizan torneos de futbol, carreras de caballo, enviando invitaciones a las comunidades circunvecinas para que participen.