Der Legende nach hatten Benediktinermönche bei einer nahe gelegenen Kapelle ein Marienwunder erlebt. Durch umfangreiche Schenkungen unter anderem der Herren von Isserstedt sowie der Schenken und Vitzthume von Apolda entwickelte sich das Kloster zu einem einflussreichen Grundherrn in der Region. Im Zuge der Reformation wurde es 1536 säkularisiert und in das landesherrliche Amt Heusdorf umgewandelt,
das seinen Amtssitz in den Gebäuden des früheren Klosters hatte. Der Architekt Gottfried Heinrich Krohne plante von 1736 bis 1739 den Umbau des Amtssitzes in eine Dreiflügelanlage. Im Zuge der Realisierung dieser Planung wurden einige Gebäude des Klosters abgerissen. In den 1680er Jahren gab es erneute Umbaupläne; die Umgestaltung des Amtssitzes zu einem Lustschloss wurde allerdings nicht realisiert.
1845 erfolgte der Abbruch großer Teile der Anlage für den Bau der Thüringer Bahn im Abschnitt von Erfurt über Weimar und Apolda nach Naumburg (Saale). Die verbliebenen Gebäude wurden nach 1945 stark verändert oder abgerissen, so dass heute außer einigen früheren Wirtschaftsgebäuden leider nichts mehr erhalten ist. Mit dieser Seite soll verhindert werden, daß dieses Kloster in Vergessenheit gerät. Vielleicht gelingt es, wenigstens einen großen Gedenkstein am ursprünglichen Ort des Klosters zu errichten.
