Fundada em 29 de julho de 2010, por decreto de sua excelência reverendíssima D. Romualdo Matias Kujawski, bispo Diocesano da Diocese de Porto Nacional, Estado do Tocantins, sob a proteção de Nossa senhora das Mercês. A comunidade paroquial desenvolve seu trabalho missionário na região da periferia da cidade de Gurupi - TO a mais de 10 anos, inicialmente como Capela pertencente à Paróquia Santo Ant
ônio. Com o desenvolvimento da região e um clamor pela presença mais real da Eucaristia e do atendimento à comunidade, deu-se o início da caminhada para a elevação da então Capela ao status de Paróquia, assim sob a direção do então Pároco da Paróquia Santo Antônio, Monsenhor Jones Pedreira com o auxílio de seu Vigário Padre Edilvan Cavalcante Milhomem, a comunidade recebeu atenção especial no desenvolvimento das ações pastorais, bem como a integração entre as comunidades vizinhas. Assim Padre Edilvan foi nomeado administrador da região composta pelas comunidades Nossa Senhora do Perpétuo Socorro - Vila São José, Bom Jesus - Centro, São José - Centro, Senhor do Bonfim - Jardim Sevilha, e a sede Comunidade São João Batista. A comunidade São João Batista foi então posteriormente elevada a Curato (comunidades, aldeias e povoados com as condições necessárias para se tornar uma paróquia) em ocasião de visita feita por Dom Romualdo, tendo em vista o rápido desenvolvimento da comunidade. Pouco tempo depois a comunidade recebeu a graça de sua elevação a Paróquia no dia 29 de julho de 2010, ainda sob administração de Padre Edilvan, terminado a adiministração do Padre Edilvan o Padre Vanderlan Cunha dos Santos assumiu a paróquia São João Batista até o ano de 2016, atualmente a paróquia está sob a administração do Padre Joaquim Mizael.